MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY06

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009472	CGGT	2	8	430	437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009472	GGC	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009472	CATG	2	8	510	517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009472	GCT	2	6	569	574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009472	A	6	6	657	662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009472	T	6	6	703	708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009472	G	6	6	770	775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009472	G	11	11	795	805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009472	ATG	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009472	A	8	8	818	825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009472	T	7	7	828	834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009472	CTGC	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009472	AGG	2	6	927	932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009472	GGC	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009472	T	7	7	1003	1009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009472	GGA	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009472	TGA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009472	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009472	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009472	G	8	8	4479	4486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009472	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009472	GGGA	2	8	4550	4557	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009472	GC	3	6	4561	4566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009472	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009472	GGC	2	6	4583	4588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009472	GGGA	2	8	4590	4597	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009472	GC	3	6	4601	4606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009472	GCG	2	6	4613	4618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009472	GGC	2	6	4623	4628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009472	GGGA	2	8	4630	4637	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009472	GC	3	6	4641	4646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009472	GCG	2	6	4653	4658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009472	GGC	2	6	4663	4668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009472	GGGA	2	8	4670	4677	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009472	CTGG	2	8	4685	4692	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009472	TCAGAT	2	12	5491	5502	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_009472	AAG	2	6	5544	5549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009472	ACT	2	6	5635	5640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009472	CTG	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009472	GTT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009472	TGT	2	6	5840	5845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009472	TCCC	2	8	5897	5904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_009472	CTC	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_009472	CCA	2	6	6052	6057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009472	GCCT	2	8	6093	6100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009472	CGAG	2	8	6119	6126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009472	TAG	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009472	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009472	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009472	AAT	2	6	6278	6283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009472	TTC	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009472	TTG	2	6	6351	6356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009472	CG	3	6	6377	6382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009472	CGA	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009472	GC	3	6	6632	6637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009472	CGG	2	6	6950	6955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009472	GCG	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009472	GGC	2	6	6983	6988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009472	GAT	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009472	CTG	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009472	GCC	2	6	7185	7190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009472	AGC	2	6	8718	8723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.